Estágios Nacionais

Mapa de Vagas - CECEFs


ICSV - Life and Health Sciences Research Institute

Exploring Sorting Nexin 27 role in Aging - Neide Vieira, PhD and Susana Roque, PhD

1 estudante 10-21Jul OCUPADA / 1 estudante 7-18Ago / 1 estudante 21Ago-1Set

Sorting nexins (SNXs) are a family of proteins that play pleiotropic roles in protein trafficking and that have been associated with endocytic events underlying neurodegeneration, synaptic plasticity and cognition [1-4]. Despite this, not much is known about SNXs role in the nervous system and how their function is modulated by aging, age-related pathologies and stress; conditions that are inextricably linked to endocytic dysregulation, cognitive decline and synaptic malfunction. Previous data from the host lab demonstrated that SNX27 expression is highly variable between aged individuals, and tends to increase with age. Taking into consideration the recent findings that SNX27 is tightly associated with Down's syndrome [3] and Alzheimer's disease [5], were its expression is markedly reduced, we believe healthy individuals display a compensatory mechanism. To dissect SNX27 role in aging, we plan to study SNX27 heterozygous mice (KO mice are not viable) and littermate controls, housed under standard conditions, at 3, 6, 12 and 18 months of age. Animals will be analysed for several behavioral dimensions: locomotion, emotion and cognition. Behavioral assessment will be performed in the following order: open field (OF; locomotor and exploratory behavior), working memory water maze (WM; spatial short-term memory), Morris water maze (MWM; spatial reference memory) and spatial reversal (behavioral flexibility). We also aim to understand how aging impacts on SNX27 protein expression and subcellular localization (co-localization with endocytic markers), its membrane-association and to analyze how changes in their expression impact on neuronal morphology, volumes and cell numbers.

Aims  1. Characterize SNX27 expression by RT-PCR and western-blot analysis in young and aged rodents in wild-type and Snx27+/- mice; 2.Evaluate distinct behavioral dimensions of young and aged rodents in wild-type and Snx27+/- mice.

References 1.  Cullen, P.J., Endosomal sorting and signalling: an emerging role for sorting nexins. Nat Rev Mol Cell Biol, 2008. 9(7): p. 574-82; 2.  Teasdale, R.D. and B.M. Collins, Insights into the PX (phox-homology) domain and SNX (sorting nexin) protein families: structures, functions and roles in disease. Biochem J, 2012. 441(1): p. 39-59; 3.  Wang, X., et al., Loss of sorting nexin 27 contributes to excitatory synaptic dysfunction by modulating glutamate receptor recycling in Down's syndrome. Nat Med, 2013. 19(4): p. 473-80; 4.  Thomas, A.C., et al., Mutations in SNX14 cause a distinctive autosomal-recessive cerebellar ataxia and intellectual disability syndrome. Am J Hum Genet, 2014. 95(5): p. 611-21; 5. Wang, X., et al., Sorting nexin 27 regulates Abeta production through modulating gamma-secretase activity. Cell Rep, 2014. 9(3): p. 1023-33.


 ICSV - Life and Health Sciences Research Institute

Exploring Sorting Nexin 27 role in Pain- Neide Vieira, PhD and Hugo Almeida, PhD

1 estudante 10-21Jul / 1 estudante 7-18Ago / 1 estudante 21Ago-1Set OCUPADA

Sorting nexins (SNXs) are a large family of phosphoinositide-binding proteins that play fundamental roles in orchestrating cargo sorting through the endosomal network. SNX27 is one of the most studied members of this family and has a well-established role in glutamate receptors trafficking regulation [1, 2]. Glutamatergic transmission is critical for nociception (acute pain) and underlies the onset and maintenance of hypersensitivity in chronic pain conditions [3] but surprisingly, no previous study assessed SNX27 potential as a therapeutical target for pain. Based on this rationale we propose to study the manifestation of acute and chronic pain in a mice model with reduced expression of SNX27. Male SNX27 -/+ mice and littermate controls will be used to assess pain-related behaviors in models of acute noxious thermal (tail- and paw-flick), tonic inflammatory (formalin) and chronic neuropathic pain (spared nerve injury, SNI). In the later, emotional and cognitive behaviors will also be characterized as these are frequently affected in chronic pain conditions [4], using the following paradigms: elevated plus maze (EPM; anxiety-like behavior), open field (OF; locomotor and exploratory behavior), forced-swim test (FST; depressive-like behavior), working memory water maze (WM; spatial short-term memory), Morris water maze (MWM; spatial reference memory) and spatial reversal (behavioral flexibility). Animals will then be anesthetized, spinal cord will be removed for c-fos immunohistochemistry and density estimation. Sciatic nerve ultrastructure will also be studied for g-ratio calculation [axon diameter/ (axon diameter+myelin thickness)]. A- and C-fiber conduction velocity and compound action potential will also be followed.

Aims  1. Evaluate the impact of decreased SNX27 expression in distinct behavioral dimensions; 2.Analyze nociception of wild-type and Snx27+/- mice; 3. Assess Snx27+/- mice tolerance to peripheral neuropathic pain;4. Evaluate neuronal volumes, cell numbers and neuronal morphology of wild-type and Snx27+/- mice exposed to SNI; 5.Quantify spinal cord neuronal activation by c-fos immunostaning in wild-type and Snx27+/- mice exposed to SNI.

References  1.Wang, X., et al., Loss of sorting nexin 27 contributes to excitatory synaptic dysfunction by modulating glutamate receptor recycling in Down's syndrome. Nat Med, 2013. 19(4): p. 473-80; 2.Loo, L.S., et al., A role for sorting nexin 27 in AMPA receptor trafficking. Nat Commun, 2014. 5: p. 3176; 3.Tao, Y.X., J. Gu, and R.L. Stephens, Jr., Role of spinal cord glutamate transporter during normal sensory transmission and pathological pain states. Mol Pain, 2005. 1: p. 30;4.Leite-Almeida, H., et al., Differential effects of left/right neuropathy on rats' anxiety and cognitive behavior. Pain, 2012. 153(11): p. 2218-25.


ICSV - Life and Health Sciences Research Institute

Stress-driven changes in synaptic interactome: a link between depression and Alzheimer’s disease  - Ioannis Sotiropoulos and Nuno Sousa

1 estudante 10-21Jul / 1 estudante 24Jul-4Ago / 1 estudante 7-18Ago OCUPADA

The World Health Organization estimates that the leading cause of mental disability in the coming years will be depression and Alzheimer’s disease (AD), raising these two diseases as significant public health problem. Focusing on risks factors of these diseases, previous clinical and experimental studies suggest a causal role of environmental parameters e.g. chronic stress and the subsequent elevation of stress hormones, glucocorticoids (GC), in pathogenesis of depression while recent findings involve stress in the onset/progression of AD. Neuronal atrophy and synaptic failure have been suggested to play an essential role in stress-related pathologies such as depression as well as in AD. Furthermore, important clues of synaptic disruption mechanism(s) previously implicated in pathophysiology of AD have been recently suggested to also contribute in stress-driven brain pathology involving, for the first time, Tau missorting in mechanism(s) of synaptic damage beyond Alzheimer’s disease (Pinheiro et al., 2015; Sotiropoulos et al., 2011). Based on the recently suggested role of Tau in synaptic structure and function interacting with NMDA receptors, PSD-95 and Fyn proteins, this project examines the alterations of synaptic interactome underlying stress-induced neuronal atrophy and synaptic loss searching for molecular targets with neuro- and synapto-protective properties.

Aims 1. Molecular characterization of stress/GC impact on postsynaptic vs extra-synaptic/presynaptic interactome 2. In vitro and/or in vivo monitoring of intracellular and synaptic trafficking of receptors and related cell signalling under stressful conditions.

References  Pinheiro S., et al., (2015) Mol Neurob, Sotiropoulos et al., (2015) JAD; Kimura et al., (2014) Phil Trans Roy Soc: Biol Scienc; Sotiropoulos I., et al., (2011) J Neurosc; Catania C., Sotiropoulos et al., (2009) Mol Psychiatry 14: 95–105; Sotiropoulos I., et al., (2008) Neurosc Biobeh Rev 32: 1161-1173.


ICSV - Life and Health Sciences Research Institute

Synaptic Tau protein: an unknown target for anesthetics malfunction? - Ioannis Sotiropoulos and Hugo Almeida

1 estudante 10-21Jul / 1 estudante 24Jul-4Ago / 1 estudante 7-18Ago 

General anesthetics (GA) are widely used drugs with various clinical applications but many studies report various cognitive problems (some persistent) after GA exposure. Previous studies have shown that different anesthetics induced Tau hyperphosphorylation whereas Tau hyperphosphorylation is related to memory deficits through brain synaptic loss. Based on the recently suggested role of Tau in synaptic structure and function interacting with various proteins such as NMDA receptors (Ittner and Gotz, 2011), we hypothesize that synaptic Tau may have a unique involvement in anesthetics action. First results of this project have shown that NMDA-related anesthetics modifies neuronal structure altering dendritic arborization and synapses in hippocampus accompanied by cognitive impairment in WTs while this effect was attenuated in absence of Tau. Thus, this project aims to clarify the role of Tau and its interaction with NMDA receptors on synaptic mechanisms underlying anesthetic-induced neuroremodeling and cognitive deficits.

Aim  Perform detailed molecular and structural analysis of synaptic cell signalling and synaptic interactome of Tau


ICSV - Life and Health Sciences Research Institute

Pain-triggered synaptic plasticity: identifying the mechanistic involvement of Tau protein - Ioannis Sotiropoulos and Hugo Leite-Almeida

1 estudante 10-21Jul / 1 estudante 24Jul-4Ago / 1 estudante 7-18Ago

Tau protein hyperphosphorylation and consequent malfunction is a hallmark of Alzheimer’s disease pathology; importantly, pain perception is diminished in these patients. In physiological conditions, Tau contributes to cytoskeletal dynamics and in this way, influences a number of cellular mechanisms including axonal trafficking, myelination and synaptic plasticity. While it is known that these cellular processes are also implicated to pain perception, it was just recently that we demonstrated the direct in vivo role of Tau in nociception (Sotiropoulos et al., 2014) showing that Tau-deficient mice display altered pain perception but the the underlying mechanisms remain unknown. Interestingly, Tau has an important role in the post-synaptic density, where, via interaction with Fyn, contributes to NMDA receptor/PSD95 complex formation the latter has also been implicated in nociception (Ittner and Gotz, 2011; D'Mello et al., 2011). Thus, this project will analyze the molecular alterations of pain-stimulated synapses with particular focus on the suggested interaction of Tau with synaptic receptors responsible for synaptic plasticity in both spinal cord and brain

Aims 1. Monitor the effect of pain stimuli on synaptic TAU phosphorylation; 2. Identify the influence of Tau on synaptic plasticity mechanisms (e.g. trafficking of synaptic receptors, interaction with scaffold proteins)

References  Sotiropoulos et al., (2014) Exper Neurol; Ittner and Gotz, (2011) Nat Rev Neurosci; D'Mello et al., (2011) Mol Ther


ICSV - Life and Health Sciences Research Institute

Tau function and dysfunction: characterization of a neuronal cell line - Andreia Carvalho, Joana Silva, Ioannis Sotiropoulos and Patrícia Maciel

1 estudante 10-21Jul / 1 estudante 24Jul-4Ago / 1 estudante 7-18Ag

The microtubule-binding protein tau (MAPT) is predominantly expressed in neurons (1). Tau is a multifunctional protein, but its major known biological function is the assembly and stabilization of microtubules, contributing to morphogenesis, cell division, axonal extension and axonal transport (2). Much evidence has been accumulated pointing to the contribution of tau to Alzheimer’s disease (AD) pathology either by loss of function (such as stabilization of microtubules) as well as gain of toxic function (aggregation and deposition of neurofibrillary tangles) (3). Although these data provide a better understanding of tau pathogenesis, the disappointing clinical outcomes of therapeutic approaches suggest that continuing efforts towards understanding tau pathology in AD as well as unravel the physiological functions of tau are needed. Thus, this project aims to focus in tau’s function and dysfunction using a human neuronal model. This will provide a unique opportunity to improve our knowledge of the biological pathways tau belongs to in a human environment and to a better understanding of the AD-disease mechanisms, contributing to improved therapeutical strategies.

Aims  1.To characterize the phenotype of neuronal cell lines overexpressing Wild type and pathogenic tau; 2. To study the effects of pathogenic tau on cell morphology, cytoskeleton, proliferation, migration and differentiation; 3. To analyze the relevance of the findings for AD in a mouse model for the disease.

References 1. Weingarten MD, Lockwood AH, Hwo SY, Kirschner MW. A protein factor essential for microtubule assembly. Proc Natl Acad Sci U S A. 1975;72(5):1858-62; 2. Drubin DG, Kirschner MW. Tau protein function in living cells. J Cell Biol. 1986;103(6 Pt 2):2739-46; 3. Rosenmann H, Blum D, Kayed R, Ittner LM. Tau protein: function and pathology. Int J Alzheimers Dis. 2012;2012:707482.


ICSV - Life and Health Sciences Research Institute

 “Stressed” proteostasis: the chronic stress impact on the orquestration of proteasomal and autophagic pathways in Alzheimer´s disease pathology - Joana Silva and Ioannis Sotiropoulos

1 estudante 10-21Jul / 1 estudante 24Jul-4Ago / 1 estudante 7-18Ago 

Tau aggregation is a common feature in Alzheimer’s disease (AD), frontotemporal dementia (FTD) and other tauopathies. Consistent with suggestions that lifetime stress may be a clinically-relevant precipitant of AD pathology, we previously showed that chronic stress and the main stress hormones, Glucocorticoids (GC), trigger Tau aggregation affecting molecular chaperones such as Hsp90 which is known to be involved in both GC signaling and Tau degradation (Sotiropoulos et al., 2015); still, the underlying mechanisms of the above stress/GC effects remain unclear. This project focuses on how stressful conditions converge on cellular mechanisms underlying Tau aggregation in AD brain monitoring tress/GC-triggered downstream degradation mechanisms (proteasome- and lysosome-related ones) mechanisms using both animal and cell culture experimental approaches.

Aims 1. Molecular and cellular characterization of ubiquin-proteasome and autophagic pathways under chronic stress and/or GC treatment; 2. Clarification of stress/GC-driven molecular mechanisms relating molecular chaperones such as Hsp90 to Tau degradation pathways.

References  Sotiropoulos et al., (2015) J Alz Dis; Sotiropoulos et al., (2011) J Neurosc; Sotiropoulos et al, (2008) J Neurochem




ISPUP - Instituto de Saúde Pública da Universidade do Porto

Epidemiologia da Nutrição e da Obesidade - Prof.ª Carla Lopes

1 estudante 10-21Jul OCUPADA

O Inquérito Alimentar Nacional e de Atividade Física (IAN-AF) 2015-2016 teve como objetivo primário recolher informação de representatividade nacional (dos 3 meses aos 84 anos de idade) sobre o consumo alimentar (incluindo a ingestão e suplementação nutricional, segurança dos alimentos e a insegurança alimentar) e sobre a atividade física (incluindo os comportamentos sedentários, as atividades desportivas/de lazer e as atividades ativas na rotina diária) e a sua relação com determinantes em saúde, nomeadamente os socioeconómicos. O objetivo especifico a desenvolver neste estágio é a avaliação do consumo de açúcares na população portuguesa, de acordo com características socio-demográficas e comportamentais. Métodos: Contacto com métodos de avaliação do consumo alimentar e do estado nutricional, bem como com métodos estatísticos para a sua a análise.

Local: Instituto de Saúde Pública da Universidade do Porto


1 estudante 24Jul-4Ago OCUPADA

No âmbito da coorte EPITeen, avaliar o efeito da metodologia de avaliação da pressão arterial na estimativa de prevalência de hipertensão arterial. Métodos: Avaliação de participantes, nomeadamente medição da pressão arterial; análise estatística e escrita de um resumo para um congresso; leitura crítica de um trabalho científico e apresentação de resultados.

Local: Instituto de Saúde Pública da Universidade do Porto / Departamento de Ciências da Saúde Pública e Forenses e Educação Médica, Faculdade de Medicina da Universidade do Porto


ISPUP - Instituto de Saúde Pública da Universidade do Porto

Epidemiologia Perinatal e Pediátrica - Prof. Henrique Barros

1 estudante 7-18Ago OCUPADA

O estudante irá integrar as atividades do projeto SHIPS (Screening to Improve Health in Very Preterm Infants in Europe) que tem como principal objetivo avaliar o impacto dos programas de rastreio, prevenção e acompanhamento na saúde, cuidados e qualidade de vida de crianças muito pré-termo. Pretende também descrever em relação a esses programas a extensão da cobertura, capacidade de resposta às necessidades, equidade e custos em saúde. O estudante irá colaborar nas atividades de avaliação de seguimento aos 5 anos de idade das crianças que integram a coorte EPICE ( Esta avaliação presencial envolve três fases:

1. Preenchimento por parte dos pais ou do/a cuidador/a principal de um questionário com o objetivo de recolher informação sobre a saúde e o desenvolvimento da criança, o bem-estar da família e a utilização dos serviços de saúde (acompanhamento de rotina, serviços de emergência e internamento).

2. Avaliação do neurodesenvolvimento da criança que é realizada por uma equipa de psicólogos especializados, com recurso a um conjunto de testes validados que visam medir a capacidade geral cognitiva, incluindo a memória de trabalho, a velocidade de processamento, a capacidade viso-espacial e a coordenação motora.

3. Avaliação física (antropometria, eletrocardiograma e espirometria).

Local: Departamento de Epidemiologia Clínica, Medicina Preditiva e Saúde Pública da Faculdade de Medicina da Universidade do Porto.


ISPUP - Instituto de Saúde Pública da Universidade do Porto

Epidemiologia das Doenças Infeciosas - Prof.ª Raquel Duarte

1 estudante 10-21Jul OCUPADA / 1 estudante 24Jul-4Ago / 1 estudante 7-18Ago OCUPADA / 1 estudante 21Ago-1Set OCUPADA

Tuberculose em populações vulneráveis.

Local: Instituto de Saúde Pública da Universidade do Porto.


IPATIMUP – Instituto de Patologia e Imunologia Molecular da Universidade do Porto

Cancer Signaling and Metabolism – Prof.ª Paula Soares, Doutor João Vinagre

1 estudante 24Jul-4Ago OCUPADA

Descrição brevemente. 


IPATIMUP – Instituto de Patologia e Imunologia Molecular da Universidade do Porto

Differentiation and Cancer – Prof.ª Raquel Almeida

2 estudantes 10-21 Jul OCUPADAS

Descrição brevemente. 


FMUP - Departamento de Cirurgia e Fisiologia

The systemic effects of left ventricular chronic pressure overload: looking outside the box - Professor Doutor Leite-Moreira

2 estudantes 24~Jul - 4 Ago OCUPADAS

Cardiac adaptations promoted by chronic pressure overload are well described; however its systemic impact early in the disease course is poorly described. Some studies raise the possibility of the heart as a modulator of other organs and tissues through secreted molecules, the cardiokines. The adipose tissue and skeletal muscle are probably targets of the cardiokines released as a response to chronic pressure overload. 

In this study we investigate the effects of left ventricular chronic pressure overload in the right ventricle, as well as in adipose tissue and skeletal muscle. The student will perform extraction and quantification of RNA by real time PCR and analysis of the function of isolated fibers from skeletal muscle. Samples from rats submitted to aortic constriction and control animal will be used.

Local: Edifício CIM – Rua Dr Plácido Costa, 4200-450, Porto, Portugal - Edifício Poente – 6º Piso





CNC.IBILI – Centro de Neurociências e Biologia Celular

Metabolismo e Controlo de Qualidade Celular - Prof. ª Paula Moreira, investigadora Sónia Correia 

1 estudante 10-21Jul OCUPADA

Sabendo que a doença de Alzheimer é caracterizada por uma deficiente oxigenação de determinadas áreas cerebrais, este estágio visa avaliar a resposta adaptativa e de sobrevivência à hipoxia mediada pelo fator de transcrição HIF-1α durante a progressão desta doença neurodegenerativa. Neste estágio irá ser usado um modelo in vitro da doença de Alzheimer (células SH-SY5Y diferenciadas expostas a condições que mimetizam a doença). O aluno terá a oportunidade de cultivar, diferenciar e manter as células e de realizar testes de viabilidade celular e técnicas de imunocitoquímica e Western blotting. 

Local: Centro de Neurociências e Biologia Celular 1º piso da Faculdade de Medicina – Pólo I Universidade de Coimbra


CNC.IBILI – Centro de Neurociências e Biologia Celular 

Metabolismo e Controlo de Qualidade Celular - Prof. ª Paula Moreira, investigadora Susana Cardoso

1 estudante 24Jul-4Ago OCUPADA

O trabalho que o aluno irá acompanhar destina-se a explorar a relação entre o estado energético neuronal e o aparecimento dos marcadores neuropatológicos da doença de Alzheimer. Para tal, irá ser utilizada uma linha de neuroblastoma diferenciada em neurónios que irá ser exposta a diferentes níveis de glicose. Além disso, queremos avaliar se a proteína desacopladora 2 da mitocôndria tem um papel protetor nas nossas condições experimentais. Para tal, irá ser usado um inibidor farmacológico dessa proteína. Neste estágio o aluno terá a oportunidade de aplicar técnicas de biologia celular e bioquímica. 

Local: Centro de Neurociências e Biologia Celular 1º piso da Faculdade de Medicina – Pólo I Universidade de Coimbra


CNC.IBILI – Centro de Neurociências e Biologia Celular  

Metabolismo e Controlo de Qualidade Celular - Prof. ª Paula Moreira, investigadora Cristina Carvalho

1 estudante 21Ago-1Set OCUPADA

Neste estudo pretendemos avaliar o papel de uma proteína supressora de tumores, cuja atividade interfere com a função das mitocôndrias, a principal fonte geradora de energia nos neurónios, na neurodegenerescência associada à diabetes tipo 2. Aplicando técnicas de biologia celular e molecular, o aluno irá avaliar parâmetros mitocondriais e marcadores de neurodegenerescência num modelo in vitro da doença. 

Local: Centro de Neurociências e Biologia Celular 1º piso da Faculdade de Medicina – Pólo I Universidade de Coimbra


 CIAS - Centro de Investigação em Antropologia e Saúde

Past Cultures and Populations - Doutor Vítor Matos

2 estudantes 24Jul-4Ago

Descrição do estágio disponível em breve

Condições especiais para alojamento e refeições, através de acordo com a SASUC - para mais informações contacta


Faculdade de Farmácia da Universidade de Coimbra

Laboratório Tecnologia Farmacêutica - Professora Carla Vitorino 

1 estudante 10-21 Jul

Are lipid nanoparticles suitable carriers for brain drug delivery? Brain targeting represents a great therapeutic challenge. Drug delivery to the brain is strictly regulated by the blood brain barrier (BBB), which represents an overwhelming obstacle for many central nervous system (CNS) drugs. This project aims to develop a formulation of lipid nanoparticles, and characterize it in terms of size, surface charge, loading capacity, and also to assess its influence on the BBB cross ability.

Principais métodos a realizar pelo estudante: Production nanoparticles through high pressure homogenization and physicochemical characterization

Local: Laboratório de Tecnologia Farmacêutica, FFUC





CEDOC – Centro de Estudos de Doenças Crónicas

Neuronal Growth and Plasticity - Prof. ª Rita Teodoro

1 estudante 10-21Jul OCUPADA

1 estudante 10-21 Jul (LIVRE)

Descrição do estágio brevemente 


CEDOC – Centro de Estudos de Doenças Crónicas


1 estudante 10-21 Jul OCUPADA

Metabolic diseases affect millions of people, contributing to significant morbidity and mortality worldwide. The number of suffers of type 2 diabetes will exceed half a billion by 2040 The rates of control and therapeutic efforts to prevent their progression and co-morbidities remain unsatisfactory. We have previously shown that the abolition of carotid body activity, through surgical resection of its sensitive nerve, the carotid sinus nerve (CSN), restores insulin sensitivity and glucose tolerance in prediabetes animal models via a re-establishment of sympathetic nerve activity. Additionally, our group described that this reestablishment of metabolic parameters involved the recovery of insulin signaling in insulin-sensitive tissues as well as the improvement of glucose uptake by the liver and by the visceral adipose tissue. In this project we will investigate in detail the cellular mechanisms behind the restoration of insulin sensitivity and glucose tolerance due to the resection of the carotid sinus nerve.
Principais métodos: avaliação metabólica em roedores - testes de sensibilidade à insulina, provas orais de tolerância à insulina, recolha de sangue, Western-blot, processamento de amostras para histologia e immunohistoquimica.
Local: edificio principal do CEDOC e biotério da NMS-FCM


CEDOC – Centro de Estudos de Doenças Crónicas

Cell Death and Disease - Prof.ª Helena Vieira

1 estudante 21 Ago - 1 Set  OCUPADA

Monóxido de carbono e neuroglobina contra a morte celular na isquemia cerebral perinatal
A isquemia cerebral perinatal é responsável por 23% de todas as mortes neonatais em todo o mundo. Esta doença é o resultado de baixos níveis de oxigénio e nutrientes no tecido cerebral de neonatais, devido a episódios de asfixia. Ao nível celular, esta doença caracteriza-se por uma exacerbação da inflamação, stress oxidativo e, numa última fase, na morte celular.
Atualmente, a hipotermia é a única abordagem terapêutica autorizada. Contudo, o período para aplicação desta terapia é curto, o que compromete diretamente a sua eficácia e o outcome dos pacientes. Assim, existe uma necessidade urgente na criação de terapias alternativas.
Nós e outros autores provamos que o monóxido de carbono (CO), quando aplicado em doses baixas em modelos celulares e animais, é benéfico em situações de isquemia cerebral, especificamente em casos de isquemia cerebral perinatal. Dados recentemente publicados indicam igualmente que a expressão neuroglobin (Ngb), uma proteína que é descrita como sensor de oxigénio, está diretamente relacionada com um melhor outcome em modelos de isquemia cerebral. Alguns dados apontam igualmente para uma interação direta entre as moléculas de Ngb e CO.
Assim, a nossa hipótese de trabalho é que a Ngb e o CO interagem numa mesma via de proteção contra a isquemia cerebral, ativando mecanismos de proteção celular contra inflamação e stress oxidativo e melhorando o metabolismo das células afetadas.

O estágio de Verão estará inserido numa primeira fase do projeto (utilizando modelos in vitro), no qual tentaremos provar se o CO modela a expressão de Ngb e se esta alteração é crucial para a proteção celular. O aluno irá acompanhar o trabalho de uma aluna de doutoramento, sendo que o progresso de mesmo ditará as técnicas que o aluno irá experienciar. No entanto, é esperado que o aluno tenha contacto com técnicas básicas de cultura celular, para estabelecimento de modelos celulares, técnicas clássicas de proteómica (western blot) e,  possivelmente, com técnicas de citometria de fluxo, para determinação da viabilidade celular.

Local: Cell Death and Disease Lab – CEDOC (Lisboa) 


IMM – Instituto de Medicina Molecular

Biologia Computacional - Prof. Nuno Morais

1 estudante 10-21Jul OCUPADA

Questão científica do projeto: O envelhecimento da população mundial e o seu papel como fator de risco para inúmeras doenças levam a uma necessidade de investigar os mecanismos do envelhecimento humano. O processo de splicing alternativo, que leva à produção de diferentes transcritos a partir do mesmo gene, desempenha um papel importante na regulação da expressão génica e tem vindo a ser relacionado com o envelhecimento. Por isso, pretendemos identificar alterações neste processo com a idade, à escala do genoma, bem como as suas causas e consequências, e entender as diferenças entre indivíduos que envelhecem de forma saudável e aqueles que vão desenvolvendo patologias, por forma a encontrar potenciais alvos terapêuticos.  

Principais métodos: O estagiário irá lidar com a informação clínica – em particular o historial médico – associada aos dados de sequenciação de RNA que estão a ser analisados neste projeto. Estes dados foram produzidos a partir de amostras post-mortem recolhidas de vários tecidos de mais de 500 indivíduos pelo consórcio Genotype-Tissue Expression (GTEx). O estagiário irá utilizar os seus conhecimentos para compreender o impacto do historial médico no perfil dos diferentes tecidos (i.e. quais os tecidos que poderão ser afetados por determinadas doenças ou circunstâncias de morte) e definir grupos de indivíduos considerados saudáveis. 

Pré-requisitos: Não são necessários conhecimentos prévios de programação, embora seja necessário conforto na utilização de Microsoft Office Excel, assim como fluência na língua inglesa. Será dada preferência a alunos que tenham concluído o 2º ano de estudos à data do estágio.

Local: Instituto de Medicina Molecular Faculdade de Medicina da Universidade de Lisboa  Avenida Professor Egas Moniz, 1649-028 Lisboa, Portuga


IMM – Instituto de Medicina Molecular

Morfogenese Vascular - Prof. Cláudio Franco

1 estudante (sem período definido, e com perspetiva de continuidade)

Tópico Modeling collective cell migration

Mais informações brevemente

Pré-requisitos: Bons conhecimentos em Matlab, e código emPhyton e/ou C++. O estudante deve ser versátil, organizado, entusiasta e trabalhador.


IMM – Instituto de Medicina Molecular 

Morfogenese Vascular - Prof. Cláudio Franco

1 estudante (sem período definido, e com perspetiva de continuidade) 

Tópico Easy ES cell

Mais informaçõpes brevemente

Pré-requisitos: Experiência em culturas celulares, células estaminais embrionárias e clonagem. O estudante deve ser versátil, organizado, entusiasta e trabalhador.


IMM – Instituto de Medicina Molecular

Neurobiologia Humana e Cognição - Prof. Diana Prata

1 estudante (sem período definido, e com perspetiva de continuidade) OCUPADA

Descrição do estágio brevemente

Pré-requisitos: Estudantes entre o 4-6ano do MIM, interesse em Neurociências, residente/estudante na área de Lisboa


ITQB – IBET Instituto de Biologia Experimental e Tecnologia 

ACTU: Animal Cell Technology Unit – Prof. ª Catarina Brito

1 estudante 10-21Jul OCUPADA / 1 estudante 24Jul-4Ago OCUPADA

Hoje em dia é reconhecido o importante papel do microambiente tumoral (diferentes tipos celulares, matriz extracelular) no desenvolvimento da doença e na resposta aos fármacos. Os tumores são cada vez mais vistos como tecidos de elevada complexidade, onde não apenas as células tumorais contribuem significativamente para a sua evolução. Deste modo, é essencial incorporar modelos celulares tumorais representativos do microambiente tumoral nas etapas iniciais de descoberta de novos fármacos, de modo a testar a sua eficácia numa fase ainda preliminar deste processo, e assim evitar que a utilização de modelos mais simplisticos e menos representativos da histopatologia tumoral forneça uma resposta enviesada ao nível da eficácia dos fármacos. O estabelecimento de co-culturas de células epiteliais tumorais com fibroblastos e células do Sistema imunitário são apenas um exemplo de uma estratégia a seguir para recapitular determinados eventos da progressão tumoral. A utilização de material derivado de pacientes é também altamente vantajosa porque nos permite preservar a arquitectura e heterogeneidade do tecido. Seguindo esta estratégias, poderemos contribuir para reduzir as elevadas taxas de ineficácia de translação de novos fármacos de ensaios clínicos para aprovação e utilização em pacientes.

Métodos: O estudante acompanhará os investigadores do nosso laboratório nas técnicas tradicionais de cultura celular, desde manipulação de células em condições de esterilidade, expansão das mesmas, estabelecimento de culturas tridimensionais. Os estudantes também poderão assistir ao processamento de amostras tumorais derivadas de pacientes, desde a manipulação e digestão do tecido inicial, até ao estabelecimento de culturas em formato de “explante” ao longo da duração do estágio. Para caracterização das culturas, será feita uma análise microscópica, com a utilização de sondas fluorescentes para caracterização de viabilidade celular. Outros ensaios mais quantitativos ao nível de metabolismo celular, quantificação de ATP e de enzima LDH no sobrenadante da cultura, permitirão caracterizar a progressão da cultura ao nível da morte celular. Os estudantes também poderão acompanhar ensaios celulares de tratamento com fármacos (agentes de quimioterapia), para avaliar a eficácia destes nas culturas entretanto estabelecidas.

 Local: Av. República, Qta. do Marquês (Estação Agronómica Nacional), Oeiras - Edificio IBET/ITQB


IGC - Instituto Gulbenkian de Ciência

 Innate Immunity and Inflammation - Prof. Luís Moita

2 estudantes 10-21 Jul OCUPADAS

Descrição do estágio brevemente disponível

Local: edíficio principal IGC - Rua da Quinta Grande, 6, 2780-156 Oeiras





CINTESIS / Centro Hospitalar do Algarve - Hospital de Faro

CriticalMed - MEDOC - Daniel Nunez, Prof.ª Dra. Cristina Granja

1 estudante 7-18Ago / 1 estudante 21Ago-1Set
Aim: To establish the epidemiological and etiological fungi in critically ill patients who are hospitalized in intensive care and intermediate region of the Algarve.

Este estudo já esta na fase de análise dos dados. O estudante poderá colaborar no preenchimento dos dados que estão ainda em falta na base de dados que será a final 

Local: Centro Hospitalar do Algarve - Hospital de Faro


CriticalMed - CODEXPRO - Isabel Jesus Pereira, Prof.ª Dra. Cristina Granja 

1 estudante 24 Jul - 4 Ago

Cognitive outcome after dexmedetomidine versus propofol – A multicenter study

Este projecto pretende estudar se a sedação mediada através da activação dos receptores α2 adrenérgicos (dexmedetomidina) resulta numa menor disfunção cognitiva do que a sedação por sedativos que actuam nos receptores GABA (propofol).

Objectivo específico:Medir a função cognitiva até ao ano após a alta da UCI em dois regimes de sedação. Medir a resposta inflamatória nos doentes que desenvolvem disfunção cognitiva 

O estudo ainda não começou mas irá começar em breve pelo que o estudante poderá colaborar no recrutamento e registo dos doentes incluidos e excluidos.

Local: Centro Hospitalar do Algarve - Hospital de Faro


CriticalMed - ICU Mortality and Outcome - Silvia Castro, Prof.ª Dra. Cristina Granja 

1 estudante 10-21 Jul

Este estudo está inserido no programa de follow-Up da UCI instalado no nosso serviço e analisa de forma longitudinal a evolução da mortalidade e factores de risco associados. Na consulta de follow-up da UCI os doentes são seguidos até ao ano e são avaliados diversos parametros para além da mortalidade e que incluem a qualidade de vida, a ansiedade, depressão e risco de stress postraumatico, entre outros.

 O estudo está a decorrer, pelo que o estudante poderá colaborar na colheita de dados para a base de dados especifica.

Local: Centro Hospitalar do Algarve - Hospital de Faro